《百鬼图鉴》是一个卡牌养成策略回合制游戏，以中国古代神话故事为背景，玩家扮演唤灵师，召唤百鬼，征战阴阳两界。

天地生万物，混沌分阴阳。

阴阳两界自天地开化以来，已维持数千万年的平衡，黄泉为路，奈何为桥，分隔了生与死的界限，也是两界交流的唯一通路。然而不知道从什么时候开始，阴阳两界的本源之力发生外泄，引发了两界动荡，界壁破碎，进出阴阳两界的道路不再唯一。

于是鬼魂们能够感应到来自现世羁绊的牵引而以魂体形式从漏洞中穿过界壁到达阳间；在阳间已死亡并失去魂魄的尸体也诞生出灵智，其中不乏很多已死去多年的远古凶尸。

人族与妖族作为阳界的原住民，不满鬼族与尸族瓜分原本阳界的资源。人妖两族联手摆下九九归一大阵，希望能重分阴阳。不料被鬼尸两族闻讯破坏，法阵失控，世界进一步崩塌破碎。崩塌的世界化为无数世界碎片，四族中一些野心者觊觎其中的阴阳本源之力，出手争夺。

世界持续崩塌破碎，一时之间，天下恐慌，四族互相仇视，各族皆苦。

主角是一个唤灵师。唤灵师这个职业，虽然都是人族，但从不介入鬼人妖尸四族的纷争。他们游历天下，无论哪一族遇到了艰难困苦，他们都会给予帮助，予以拯救。用他们自己的说法，这是大爱。

主角作为唤灵师中极为杰出的一员，修炼阴阳之道，并在修炼之中受到天地之灵的感召，发现了解决世界危机的契机。现在摆在主角面前的有两条路可以走：

一、收集破碎世界的碎片，转化为原初的混沌气息，用于修补即将崩塌的世界并将其还原。

二、将转化成的混沌气息收为己用，苦修阴阳之道，大成后可开辟一个较小的新世界，供四族继续生存。